Det var det kun med nød og næppe at godsejer Henning Rottbøll og stiftamtmanden overbeviste besættelsesmagten om at lade familien blive boende i vestfløjen, da de ellers skulle have forladt klosteret.
Børglum Kloster blev under besættelsen omdannet til en militær pindsvinestilling. Markerne omkring klosteret blev gennemgravet af 4-6 meter brede og ca. 4 meter dybe pansergrave. Disse pansergrave var omkranset med pigtrådspærring.
Pansergravene strakte sig over 11 kilometer i alt. Der boede 150 soldater på mejerigården og overalt var opstillet dobbelte vagtposter. I en bunker i klosterets nord-have samledes alle telefonledninger til stillingerne der lå nede langs kysten.
Omkring denne bunker var også gravet skyttegrave, ligesom der var talrige andre skyttegrave på klosterets område.
Kilde: Børglum Kloster.